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利用Crispr技术筛选出胶质母细胞瘤免疫治疗新靶点

[所属分类:新闻动态] [发布时间:2019-9-25] [发布人:] [阅读次数:] [返回]

山东拓普生物工程有限公司

Shandong Tuopu Biol-Engineering Co.,Ltd

2019年9月23日,陈斯迪(Sidi Chen)团队在Nature Biotechnology上发表题为In vivo CRISPR screening in CD8 T cells with AAV–Sleeping Beauty hybrid vectors identifies membrane targets for improving immunotherapy for glioblastoma 的一项研究。作者从胶质母细胞瘤模型入手,通过CRISPR筛选技术并结合腺相关病毒(Adeno-associated virus,AAV)和“睡美人”(Sleeping Beauty)转座子系统筛选得到了多个新型的肿瘤免疫治疗新靶点。值得一提的是,这是该团队继上个月在Cell上发表的第二篇关于CRISPR筛选用于肿瘤免疫治疗新靶点发现的文章,Matthew Dong和叶露鹏博士同样是Cell文章的第一作者 (详见BioArt报道:Cell | 陈斯迪组首次在CD8 T 细胞中实现体内全基因组CRISPR 筛选并发现全新的免疫治疗新靶点)。

胶质母细胞瘤是星形细胞肿瘤中恶性程度最高的胶质瘤。肿瘤位于皮质下,多数生长于幕上大脑半球各处。呈浸润性生长,常侵犯几个脑叶,并侵犯深部结构,还可经胼胝体波及对侧大脑半球。发生部位以额叶最多见。且胶质母细胞瘤生长速度快,70%~80%患者病程在3~6个月,病程超过1年者仅10%。病程较长者可能由恶性程度低的星形细胞瘤演变而来。因此免疫检查点疗法的重要性不言而喻

作者首先构建了一个膜蛋白相关的基因敲除文库,希望通过CRISPR 筛选技术找出全新的免疫治疗新靶点。高效的基因编辑鼠源CD8 T 细胞一直是该领域的难点,常规的细胞转染和慢病毒递送方法都无法实现高效的基因打靶。在本研究中,作者发现用腺相关病毒(AAV)递送sgRNA可以很好的实现基因打靶。然而,AAV是一类非整合的病毒,随着细胞的增殖,AAV 会慢慢的丢失。为了能让AAV递送的DNA元件可以整合到细胞的基因组,研究人员在AAV 载体上装了一个超高活性的“睡美人”转座子,这样可以利用转座子系统将包裹在AAV 中的DNA元件整合到基因组中,这在后续的筛选实验中非常重要。研究人员将膜蛋白相关的基因打靶文库克隆到AAV-SB-CRISPR 在体中,然后包装成AAV病毒之后感染CD8 T 细胞,最后将T 细胞通过尾静脉注射到患有GBM的小鼠体内。筛选结果显示Pdia3,Mgat5,Emp1,Lag3,Pde5a,Ccdc80,Defb26等多个基因得到了高度的富集。值得一提的是,研究人员做了三次独立的在体筛选,发现Pdia3,Mgat5和Emp1惊人的富集在三次的筛选中。


耶鲁大学利用Crispr技术筛选出胶质母细胞瘤免疫治疗新靶点


为此,在后续的验证实验中研究人员重点对Pdia3, Mgat5和Emp1这三个基因进行了验证,尤其是Pdia3,在免疫治疗领域从来没有被报道过。在抗原和CD8 T 细胞特异识别的实验中,作者发现Pdia3, Mgat5或Emp1敲除的CD8 T 细胞可以增强T细胞的抗肿瘤活性,延长了小鼠的生存时间。与对照组相比,肿瘤浸润T细胞的比例也有了显著地提高。研究人员还尝试了颅内直接注射Pdia3或Mgat5敲除的CD8 T 细胞,发现同样可以延长小鼠的生存时间。跟进实验结果显示 Pdia3敲除后显著地提高了促炎症相关基因的表达, 结果显示T 细胞激活信号通路(T cell signaling pathway)变得更加灵敏,只需低浓度的CD3刺激便可快速的激活T细胞。 研究人员尝试了三阴乳腺癌模型,发现T细胞Pdia3敲除也可以明显的限制肿瘤的生长。 作者同样在人CD8 T 细胞中进行了验证。研究人员首先建立了PDIA3敲除的人CD8 T细胞,发下PDIA3敲除之后同样提高了 T 细胞功能和一些共刺激因子的表达。最后作者构建了胶质母细胞瘤的CAR-T 细胞,在体外杀伤实验中,PDIA3敲除的EGFRvIII CAR-T细胞具有更强的肿瘤杀伤能力。

总之,本研究对传统CRIPSR筛选技术进行了优化,将CRISPR筛选系统与AAV和转座子结合起来,提供了一个全新且高效的CRIPSR筛选方法。作者利用该方法对膜蛋白进行了筛选,最终得到了多个全新的肿瘤治疗新靶点,为今后抗肿瘤免疫治疗提供了新思路和新手段。


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