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分离出近八千种人体消化道菌株样本
山东拓普生物工程有限公司
Shandong Tuopu Biol-Engineering Co.,Ltd
消化道是一条起自口腔延续咽、食道、胃、小肠、大肠、到肛门的很长的肌性管道,其中经过的器官包括口腔、咽、食管、胃、小肠(十二指肠、空肠、回肠)及大肠(盲肠、结肠、直肠)等部,且人体80%的免疫系统都位于消化道上。人体消化道是成千上万种不同细菌的家园。美国麻省理工学院和布罗德研究所目前已分离保存了近 8000 种人体消化道菌株的样本,并揭示了其遗传和代谢背景。
研究小组在长达两年的时间里收集了大约 90 人的粪便样本,深入了解了微生物种群在个体内的变化情况。这项研究的重点是生活在波士顿地区的人们,但研究小组也在收集来自全球各地的更多样本,希望能够保留生活在工业化社会中的人们所没有的微生物菌株。
研究人员从主导人类胃肠道的 6 种主要细菌门类中分离出总共 7758 种菌株,并对其中 3632 个菌株进行了全基因组测序。通过分析单个宿主中微生物种群随时间的变化,发现了菌株之间的一些新的相互作用。在一个案例中,他们发现 3 种相关的拟杆菌菌株在宿主体内共存,所有这些菌株似乎都与宿主体内的一个祖先菌株不同;在另一个案例中,一株菌株几乎在一夜之间完全取代了相同物种的相关菌株。
研究人员还测量了粪便样本中发现的许多代谢物的数量。该分析显示,氨基酸水平的变化与单个人体内微生物种群随时间的变化密切相关。而且,不同人群中微生物种群组成的差异与不同水平的胆汁酸密切相关,胆汁酸有助于消化。
肠道内的微生物有多少?过去我们只能说,成千上万种,好几公斤重。而此次通过 “拉网式” 调查,我们拟出了相对详尽的清单。过去只能笼统地说,肠道菌群在消化和免疫中是不可或缺的主角;而通过观察它们随时间的变化,以及分析代谢物,我们将辨认出每一种微生物的角色,由此医治各种顽疾。