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KnockTF数据库

[所属分类:新闻动态] [发布时间:2020-1-2] [发布人:] [阅读次数:] [返回]

山东拓普生物工程有限公司

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 KnockTF数据库是一个全面的人类转录因子敲降/敲除的基因表达谱数据库。转录因子(Transcription Factor, TF)及其靶基因在人类疾病和生物学过程中起重要作用,转录因子敲降/敲除前后的基因表达谱分析是获得转录因子靶基因、探索转录因子功能的最重要策略之一。  

哈尔滨医科大学大庆校区医学信息学系李春权教授的生物信息课题组在转录因子领域取得重大成果,并发表了以《KnockTF:a comprehensive human gene expression profile database with knockdown/knockout of transcription factors》为题的研究论文。
KnockTF数据库是一个全面的人类转录因子敲降/敲除的基因表达谱数据库。转录因子(Transcription Factor, TF)及其靶基因在人类疾病和生物学过程中起重要作用,转录因子敲降/敲除前后的基因表达谱分析是获得转录因子靶基因、探索转录因子功能的最重要策略之一。

KnockTF提供了大量与转录因子敲降/敲除相关的人类基因表达谱数据集、转录因子及其靶基因的注释信息、转录因子的上游通路信息和下游靶基因的功能注释信息,以及转录因子绑定到靶基因启动子、增强子和超级增强子的详细绑定信息。

KnockTF数据库构建了一个转录因子——差异表达基因网络,方便用户进行网络分析可视化,帮助阐明了转录因子相关的功能和潜在的生物学效应。上线一个月内,数据库网站点击率已达到1300余次,在转录因子的研究领域正在发挥着良好的作用,为生命科学领域提供了强大的转录因子及增强子生物信息资源和分析策略。

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